Metal Gear Solid 3: Subsistence — переиздание игры Metal Gear Solid 3. Эта версия была выпущена в Японии 22 декабря 2005 года, а позднее вышла в Северной Америке (14 марта 2006 года), в Европе (6 октября 2006 года) и в Австралии (13 октября 2006 года). В переиздании камера стала свободной, появились новые камуфляжи.На первом диске(Persistence) есть многопользовательский режим. Присутствуют и старые игры серии, такие как Metal Gear и Metal Gear 2: Solid Snake. Компонент многопользовательского режима игры, названный Metal Gear Online, включает в себя пять игровых режимов, в каждом могут участвовать до восьми игроков. Каждый игрок управляет простым солдатом и сражается с соперниками в режиме Deathmatch или Захват флага. Локации, предметы, пути передвижения и боевые единицы (солдаты КГБ, ГРУ и члены отряда «Оцелот») заимствованы из основной игры. Также присутствует потешная игра Snake vs Monkey, где Снейк должен с помощью пистолета с транквилизатором и гранат оглушить, а затем собрать всех обезьянок. На втором диске(Subsistence) содержится оригинальная Metal Gear Solid 3: Snake Eater.